近日,青島海洋科學(xué)與技術(shù)試點(diǎn)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室海洋生物學(xué)與生物技術(shù)功能實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)科學(xué)院海洋研究所科學(xué)家相建海、李富花研究員,與天津生物芯片等國(guó)內(nèi)外多家單位共同合作,歷時(shí)十年之久,成功破譯了凡納濱對(duì)蝦基因組。這是世界上首個(gè)對(duì)蝦基因組參考圖譜。
對(duì)蝦基因組是世界上公認(rèn)的高復(fù)雜基因組,阻礙了多個(gè)國(guó)際科研機(jī)構(gòu)的研究步伐。在該研究中,研究人員嘗試使用了從一代到三代的各種測(cè)序平臺(tái)以及各種組裝軟件,最終完成了凡納濱對(duì)蝦的全基因組denovo測(cè)序和組裝,獲得的參考圖譜ScaffoldN50達(dá)到606Kb。
本研究還對(duì)22個(gè)野生和養(yǎng)殖的凡納濱對(duì)蝦個(gè)體進(jìn)行了重測(cè)序,為對(duì)蝦的遺傳育種工作提供了寶貴資源。此外,通過(guò)選擇純化分析,研究人員還找到了對(duì)蝦基因組上14個(gè)受選擇的區(qū)域和28個(gè)受選擇的基因,它們可能與對(duì)蝦養(yǎng)殖環(huán)境適應(yīng)有關(guān)。
對(duì)蝦基因組的發(fā)表為甲殼動(dòng)物底棲適應(yīng)和蛻皮等研究提供了重要的理論基礎(chǔ)和數(shù)據(jù)支撐,同時(shí)也為對(duì)蝦基因組育種和分子改良工作提供了重要的基礎(chǔ)平臺(tái)。該研究得到國(guó)家863計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金、海洋試點(diǎn)國(guó)家實(shí)驗(yàn)室“藍(lán)色生命”重大成果支持計(jì)劃等項(xiàng)目資助。
