北京麋鹿苑博物館又名北京麋鹿生態(tài)實(shí)驗(yàn)中心、北京生物多樣性保護(hù)研究中心。位于大興區(qū)南海子麋鹿苑。博物館主要展示內(nèi)容有“麋鹿滄?！闭褂[（包括麋鹿與自然、鹿與文化、麋鹿苑）、世界滅絕動物墓區(qū)、東方護(hù)生壁畫等內(nèi)容。
南苑元、明、清三代皇家苑囿，現(xiàn)僅存遺址。位于北京市永定門外永定河沖積扇中部，曾是河湖廣布、草木蔥郁之地。
元始建時稱“下馬飛放泊”，是元朝貴族打獵的地方。
明永樂年間擴(kuò)大，修以圍垣，周長60公里，謂之“南海子”。周辟四門，內(nèi)建衙署，設(shè)總提督一人、提督四人負(fù)責(zé)管理。苑內(nèi)分為四部分，各有一名提督管理，管轄海戶400人。苑內(nèi)設(shè)立二十四園，養(yǎng)育禽獸，種植果蔬，供皇帝和官僚貴族打獵享樂。后日漸荒蕪，明隆慶年間，南苑已經(jīng)很衰敗。
清代繼續(xù)經(jīng)營，修建4處行宮、若干廟宇，原明朝的兩處提督衙門改建為行宮（舊衙門行宮、新衙門行宮），新建團(tuán)河行宮。南苑一部分作為操兵練武之所，筑晾鷹臺，作為檢閱臺，清帝多次在此校閱八旗軍隊(duì)。平時嚴(yán)禁平民進(jìn)入，同治間于此設(shè)神機(jī)營。苑內(nèi)多獐子、野兔、麋麂（四不象），并圈養(yǎng)老虎，作為狩獵之用。1900年，八國聯(lián)軍入侵北京，日軍闖入園中焚毀建筑、射殺動物。1901年后荒廢，由皇家發(fā)行“龍票”，準(zhǔn)招佃屯墾，始有人于苑內(nèi)搶占土地建立莊園。后神機(jī)營營房建南苑機(jī)場。
辛亥革命后仍為駐兵重地。馮玉祥在1924年建“思羅堂”，又稱“中華基督教衛(wèi)理公會南苑鎮(zhèn)福音堂”，位于南苑鎮(zhèn)西二道街1號，建筑面積167.1平方米，可容納500多人聚會，李昌源為本堂首任牧師（1894—1973，山東省泰安人，畢業(yè)于北京匯文神學(xué)院）。文革期間該房產(chǎn)被北京博蘭特食品工貿(mào)集團(tuán)南苑中心占用。
1949年后發(fā)展為北京近郊重要農(nóng)業(yè)區(qū)和工業(yè)區(qū)。位于西南隅的清團(tuán)河行宮遺址已辟為公園，南海子麋鹿苑也建在苑中。
麋鹿1985年回歸中國前，國內(nèi)外動物保護(hù)專家為麋鹿回歸做了大量準(zhǔn)備工作，其中一項(xiàng)就是選址，為麋鹿選擇一個回家的地點(diǎn)，場地的選擇對重引進(jìn)項(xiàng)目至關(guān)重要，它既要適合麋鹿生存、繁衍的要求，又要便于項(xiàng)目的實(shí)施管理和推廣。中外科學(xué)家在麋鹿歷史分布區(qū)域的遼寧、山東、江蘇、上海等地考察，最后確定北京南海子，其原因是北京南海子是麋鹿科學(xué)發(fā)現(xiàn)地、模式種產(chǎn)地、最后滅絕地，野生麋鹿的歷史分布地，處在首都，交通方便，研究機(jī)構(gòu)云集等具備多種有利條件。
現(xiàn)麋鹿苑的麋鹿已達(dá)200余頭， 并在苑內(nèi)建成野生動物散養(yǎng)區(qū)、展示區(qū)、野餐區(qū)、野營區(qū)，苑內(nèi)還有白唇鹿、馬鹿、梅花鹿、狍子等其他鹿科動物和普氏野馬等，另有灰椋鳥、大斑啄木鳥等鳥類。
